Основное отличие некоммерческих предприятий в том, что целью их деятельности не является извлечение прибыли.
А прибыль — это то, что учредители/участники/акционеры и т.д. могут распределить между собой.
В то же время некоммерческое предприятие может вести коммерческую деятельность, но доход (а не прибыль :))) должен направляться на решение уставных задач.
Подробнее об этом нужно смотреть законодательную базу, прежде всего ГК РФ
Статья 50. Коммерческие и некоммерческие организации
1. Юридическими лицами могут быть организации, преследующие извлечение прибыли в качестве основной цели своей деятельности (коммерческие организации) либо не имеющие извлечение прибыли в качестве такой цели и не распределяющие полученную прибыль между участниками (некоммерческие организации).
2. Юридические лица, являющиеся коммерческими организациями, могут создаваться в форме хозяйственных товариществ и обществ, производственных кооперативов, государственных и муниципальных унитарных предприятий.
3. Юридические лица, являющиеся некоммерческими организациями, могут создаваться в форме потребительских кооперативов, общественных или религиозных организаций (объединений), учреждений, благотворительных и иных фондов, а также в других формах, предусмотренных законом.
Некоммерческие организации могут осуществлять предпринимательскую деятельность лишь постольку, поскольку это служит достижению целей, ради которых они созданы, и соответствующую этим целям.
4. Допускается создание объединений коммерческих и (или) некоммерческих организаций в форме ассоциаций и союзов.
… И в соответствующем законе:
Федеральный закон от 12 января 1996 г. N
7-ФЗ «О некоммерческих организациях»
http://www.garant.ru/law/10005879–000.htmа с администрацие могут быть связаны и могут быть не связаны. Формально и неформально… )))